La Faculté des lettres est co-responsable des instituts interfacultaires et inter-institutionnels suivants:

• Institut de l'Europe orientale et centrale
  (avec les Facultés de théologie, de droit, des sciences économiques et sociales);
• Institut interdisciplinaire d'éthique et des droits de l'homme
  (avec les Facultés de théologie, de droit, des sciences économiques et sociales, et des sciences);
• Institut de recherche et de conseil dans le domaine de la famille
  (avec les Facultés de théologie, de droit, des sciences économiques et sociales);
• Centre d'études européennes
  (avec les Facultés de droit, des sciences économiques et sociales et de théologie);
• Institut de plurilinguisme
  (avec la Haute École pédagogique fribourgeoise).